Flyer

Journal of FisheriesSciences.com

  • Journal h-index: 32
  • Journal CiteScore: 28.03
  • Journal Impact Factor: 24.27
  • Average acceptance to publication time (5-7 days)
  • Average article processing time (30-45 days) Less than 5 volumes 30 days
    8 - 9 volumes 40 days
    10 and more volumes 45 days
Awards Nomination 20+ Million Readerbase
Indexed In
  • Academic Journals Database
  • Genamics JournalSeek
  • The Global Impact Factor (GIF)
  • China National Knowledge Infrastructure (CNKI)
  • CiteFactor
  • Electronic Journals Library
  • Centre for Agriculture and Biosciences International (CABI)
  • Directory of Research Journal Indexing (DRJI)
  • OCLC- WorldCat
  • Proquest Summons
  • Publons
  • MIAR
  • Advanced Science Index
  • International committee of medical journals editors (ICMJE)
  • Euro Pub
  • Google Scholar
  • J-Gate
  • Chemical Abstract
  • SHERPA ROMEO
  • Secret Search Engine Labs
  • ResearchGate
  • University of Barcelona
Share This Page

- (2010) Volume 4, Issue 1

The existence of Flavobacterium spp. at rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) hatcheries in Caglarca village, Mersin-Turkey

Sevgi Yildirim, Selmin Özer*

Mersin Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi, Mersin

Corresponding Author:
Selmin ÖZER
Mersin Üniversitesi Su Ürünleri Fakültesi
Yetistiricilik Bölümü, Yenisehir Kampüsü
33169 Mersin -TÜRKIYE
Tel: (+90 533) 413 68 93
Fax: (+90 324) 341 30 25
E-mail: selmin.oezer@gmail.com
Visit for more related articles at Journal of FisheriesSciences.com

Abstract

The aim of this study was to examine the existence of the Flavobacterium spp. at two different rainbow trout farm hatcheries in Caglarca village, Mersin, between December 2006 and April 2007. For this goal samples were collected from milt, ovarian fluid, and all phases from egg till 3 months old fries and from the water used in both farms. In consequence of disease outbreak at the II. farm, 30–40 days after fry started feeding, mortality occured as high as 50 %. Clinical signs at fries were observed as dark coloration of the skin, exophthalmia, erosions on dorsal and caudal fins, lethargy, swimming close to the water surface, weakness and loss of appetite. As autopsy signs anaemia and haemorrhage on gills and liver, and splenomegali were observed. Totally 347 samples, including 77 water and 270 fish samples taken from the hatcheries, were examined. Flavobacterium spp. were isolated and identified using conventional culture methods. 141 (33.71%) Flavobacterium spp. have been isolated from 117 samples. 46 Flavobacterium spp. were isolated from 39 (50.64%) water samples and 95 from 78 (28.88%) fish samples. Off the total isolates 76 (42.93%) were identified as F. aquatile, 30 (16.94%) as F. columnare, 20 (11.29%) as F. branchiophilum, 12 (6.77%) as F. johnsoniae and 3 (1.69%) as F. saccarophilum. Antimicrobial susceptibility test was carried out by agar disc diffusion method. In according to antimicrobial susceptibility test, Flavobacterium spp. strains were sensitive to gentamicin, streptomycin, neomycin, sulphamethoxazoletrimethoprim, oxytetracycline, ofloxacin, clindamycin, amoxycilin/clavulinic acid, and resistant to erythromycine, penicillin and vancomycin, respectively.

Keywords

Flavobacterium spp., Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), Antimicrobial susceptibility

Giri?

Mersin ilinde farkl? kapasitelerde 40’tan fazla Gökku?a?? alabal??? (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) i?letmesi bulunmaktad?r (TKB Mersin Tar?m ?l Müdürlü?ü, 2006, yay?nlanmam?? veri). ??letmelere göre de?i?mekle birlikte, anaç sa??mlar? genellikle hava s?cakl?klar?n?n dü?tü?ü Aral?k ay? içinde ba?lamaktad?r. Baz? i?letmelerden edinilen bilgiye göre, yem almaya ba?lad?ktan 30-40 gün sonra yavrularda yo?un ölümler meydana gelmekte, üretimdeki kay?plar?n ço?unlu?u bu a?amada gerçekle?mektedir.

Kitap bilgileri (Austin ve Austin, 1993, Baur ve Rapp, 2003, Holt ve ark., 1993, Wakabayashi, 1993) ve dünyan?n birçok ülkesinde yap?lm?? olan ara?t?rmalar (Austin, 1992, Bernardet ve ark., 1988, Bernardet, 1989, Bustos ve ark., 1995, ?spir ve ark., 2004, Korun ve Timur, 2001, Lorenzen, 1991, Madsen ve ark., 2005) bu a?amadaki yavru ölümlerinin en büyük nedeni olarak Flavobacterium türlerini göstermektedir. Bal?klar?n normal mikrofloras?nda, toprak, tatl? su ve denizel ortamda yer alan bu etkenler, bak?m, besleme ve çevresel ko?ullardaki olumsuzluklar neticesinde bal?klarda hastal?k olu?turabilmektedir (Austin ve Austin, 1993, Holt ve ark., 1993, Suomalainen ve ark., 2005).

Bugüne kadar çe?itli bal?k türlerinde birçok Flavobacterium türü bal?klarda hastal?k etkeni olarak bildirilmi?tir (Alvarado ve ark., 1989, Bader ve ark., 2003, Basson ve ark., 2007, Decostere ve ark., 1998, Holt ve ark., 1993, Lehmann ve ark., 1991, Thomas-Jinu ve Goodwin, 2004). Bu etkenlerden Flavobacterium psychrophilum (Cytophaga psychrophila) ‘gökku?a?? alabal??? yavru hastal???’, ‘bakteriyel so?uk su hastal???’ ya da ‘pedünkül hastal???’ olarak bilinen hastal?klar?; F. columnare (C. columnaris) ‘kolumnaris hastal???’ ya da ‘eyer hastal???’; F. branchiophilum ‘bakteriyel solungaç hastal???’ ve F. maritimus ‘tuzlusu kolumnarisi hastal???na sebep olmaktad?r (Austin ve Austin, 1993, Holt ve ark., 1993, Wakabayashi, 1993). Ayr?ca F. hydatis (C. aquatilis), F. Succinicans (C. succinicans) (Bernardet ve ark., 1996) ve F. johnsoniae (C. johnsonae) (Basson ve ark., 2007, Bernardet ve ark., 1996, Flemming ve ark., 2007) türleri de hasta bal?klardan izole edilmi?tir.

Bu ara?t?rman?n amac? Mersin ?li Ça?larca Köyü’nde faaliyet gösteren iki farkl? Gökku?a?? alabal??? i?letmesinde sa??mdan ba?layarak yavrular 3 ayl?k oluncaya kadar tüm geli?im basamaklar?nda ve i?letmelerde kullan?lan sulardan örnekler alarak meydana gelen yavru ölümlerinin etiyolojik nedenini ortaya ç?karmak ve izolatlar?n antibakteriyel duyarl?l?klar?n?n tespit edilmesidir.

Materyal ve Metot

Su, yumurta ve yavru örnekleri

Mersin ili Ça?larca Köyü’nde faaliyet gösteren iki farkl? Gökku?a?? alabal?k i?letmesinden Aral?k 2006 ila May?s 2007 tarihleri aras?nda, hijyen kurallar?na ve so?uk zincire uygun olarak al?nan su ve bal?k örnekleri fakültemiz laboratuar?na getirilerek ayn? gün içinde incelemeye al?nm??t?r. Örnek al?m?na anaç bal?klar?n sa??m?yla birlikte ba?lanarak, 15 günlük peryotlar halinde yavrular 3 ayl?k oluncaya kadar devam edilmi?tir. ??letmelere giren su, anaç havuzu suyu, kuluçka dolab?na giren su, yavru havuzu suyu ve i?letmeden ç?kan sudan steril ?i?elere birer litre örnek al?nm??t?r. I. i?letmeden 36, II. i?letmeden 41 örnek olmak üzere toplam 77 adet su örne?i incelenmi?tir (Tablo 1).

Genel olarak “bal?k örne?i” olarak ifade etti?imiz sperma, ovaryum s?v?s?, yumurta, döllenmi? yumurta, gözlenmi? yumurta, keseli yavru ve yem almaya ba?layan yavrulardan örnekler al?nm??t?r. 2-3 adet erkek anaçtan 1 ml’lik sperma örne?i, di?ilerden ovaryum s?v?s? ve yumurta örnekleri anaçlar?n sa??m? esnas?nda temin edilmi?tir. Her örnekleme için yumurta, döllenmi? yumurta, gözlenmi? yumurta ve yavrulardan en az 20’?er adet al?nm??t?r. Yavru örnekleri hariç, di?er bal?k örneklerinin yar?s? a?a??da belirtildi?i gibi dezenfekte edildikten sonra incelemeye al?nm??t?r. I. i?letmeden 124 ve II. i?letmeden 146 olmak üzere toplam 270 adet bal?k örne?i incelenmi?tir (Tablo 2).

Referans su?lar

Referans su? olarak Flavobacterium columnare (Gökku?a?? alabal??? izolat?, Kotterba, G., 2006) kullan?lm??t?r.

Yumurta ve keseli yavru örneklerinin dezenfeksiyonu

Yumurta, döllenmi? yumurta, gözlenmi? yumurta ve keseli yavru örneklerinin yar?s? dezenfekte edilmeden i?leme al?n?rken, di?er yar?s? 400 ppm povidin/iodin solüsyonunun 15 dakika süreyle uygulanmas? ile dezenfekte edilmi?tir (Brown ve ark., 1997, Rogers ve Chapman, 1990). Dezenfekte edilen örnekler 3 kez steril distile su ile y?kanm??t?r (Brown ve ark., 1997).

Bakteri izolasyonu ve identifikasyonu

Yumurta ile keseli yavrulardan, yem alan yavrular?n iç organlar?ndan (karaci?er, böbrek) direkt olarak ve su örneklerinin 0,5 ml’si Tryptone yeast extract salts agara (TYES-A) ekilerek 17°C’de 5-10 gün inkübasyona b?rak?lm??t?r. Sar? renkli koloniler seçilerek TYES-A’a subkültürleri yap?lm?? ve 17°C’de 5-10 gün inkübe edilmi?tir. ?zolatlar?n identifikasyonlar?nda Gram boyama, katalaz, oksidaz, hareket, fleksirubin, 30oC’de üreme, % 2 tuzlulukta üreme, ni?asta hidrolizi, indol, jelatin hidrolizasyonu, hidrojen sülfür olu?umu, glukoz ve laktoz parçalanmas?, glikozun oksidasyon-fermentasyon metabolizmas? (O/F) ve hemoliz testleri uygulanm??t?r. ?nkübasyon 17°C’de 5-30 gün olarak gerçekle?tirilmi?tir (Austin ve Austin, 1993, Brown ve ark., 1997, Holt ve ark., 2000, Dalsgaard ve Madsen, 2000, Madsen ve ark., 2005, Wiklund ve ark., 1994).

Antibakteriyel duyarl?l?k testi

Antibakteriyel duyarl?l?k testleri disk difüzyon yöntemine göre Müller-Hinton agarda yap?lm??t?r (Woodland, 2004). Gentamisin (GM, 10 μg), streptomisin (S, 10 μg), neomisin (N, 30 μg), sulfametoksazol-trimetoprim (SXT, 1.25-23.75 μg), eritromisin (E, 15 μg), amoksisilin/klavulinik asit (AmC, 30 μg), klindamisin (CC, 2 μg), ofloksasin (OFX, 5 μg), oksitetrasiklin (T, 30 μg), penisilin (P, 10 μg) ve vankomisin (Va, 30 μg) (OXOID) diskleri kullan?larak 17°C’de 5-10 gün inkübe edilmi?tir.

Bulgular ve Tart??ma

Hastal?k bulgular?

II. ??letmede yavrular yem almaya ba?lad?ktan 30-40 gün sonra ölümler görülmeye ba?lanm?? ve 3 hafta kadar süren salg?nda yavrular?n % 50’den fazlas? ölmü?tür. Hasta ve ölen bal?klarda renkte kararma, s?rt yüzgecinde erozyon, gözlerde eksoftalmus (?ekil 1 ve 2), solungaçta ve karaci?erde solgunluk, karaci?erde yer yer kanamalar ve dalakta büyüme saptanm??t?r (?ekil 3).

Bakteri bulgular?

TYES-A üzerinde üreyen sar? renkli ve Gram negatif karakter gösteren kolonilerin identifikasyonu amac?yla uygulanm?? olan fenotipik ve biyokimyasal testlerin sonuçlar? tablo 3’te yer almaktad?r. Bu verilere göre, her iki i?letmenin kuluçkahanesinden al?nan toplam 347 adet örne?in 117’sinde (% 33.71) 141 adet Flavobacterium spp. izole edilmi?tir.

Bu izolatlar?n 45’i (% 31.91) I. i?letmede ve 96’s? (% 68.08) II. i?letmede saptanm??t?r. Toplam izolat?n 76’s? (% 42.93) F. aquatile, 30’u (% 16.94) F. columnare, 20’si (% 11.29) F. branchiophilum, 12’si (% 6.77) F. johnsoniae ve 3’ü (% 1.69) de F. saccarophilum olarak belirlenmi?tir. Toplam 77 adet su örne?inin 39’unda (% 50.64) toplam 46 ve 270 adet bal?k örne?inin 78’inde (% 28.88) toplam 95 adet Flavobacterium spp. izole edilmi?tir.

Su örneklerinden izole edilen etkenlerin 27’si (% 58.69) F. aquatile, 11’i (% 23.91) F. Columnare, 4’ü (% 8.69) F. branchiophilum, 3’ü (% 6.52) F. johnsoniae ve 1’i (% 2.17) de F. Saccarophilum olarak ay?rt edilmi?tir.

Bal?k örneklerinden izole edilen etkenlerin 49’u (% 51.57) F. aquatile, 19’u (% 20) F. columnare, 16’si (% 16.84) F. branchiophilum, 9’u (% 9.47) F. johnsoniae ve 2’i (% 2.10) de F. saccarophilum olarak belirlenmi?tir.

I. i?letmede incelenen 36 adet su ve 124 adet bal?k örne?i olmak üzere toplam 160 adet örne?in 36’s?nda toplam 45 adet Flavobacterium spp. izole edilmi?tir. F. aquatile 35 (% 77.77), F. johnsoniae 6 (% 13.33) ve F. branchiophilum 4 (% 8.88) adet bulunmu?tur. Bu izolatlar?n 17’si 15 adet (% 41.66) su örne?inden (Tablo 4), 28’i de 21 adet (% 16.93) bal?k örne?inden elde edilmi?tir (Tablo 5).

II. i?letmeye ait 41 su ve 146 adet bal?k örne?i çal???lm??t?r. Bu i?letmede 95 adet Flavobacterium spp. 81 adet (% 55.47) örnekten izole edilmi?tir. Bu izolatlar?n 41’i (% 43.15) F. aquatile, 30’u F. columnare (% 31.57), 16’s? F. branchiophilum (% 16.84), 6’s? (% 6.31) F. johnsoniae ve 3’ü (% 3.15) F. saccarophilum olarak identifiye edilmi?tir. Bu izolatler?n 29’u (% 30.2) 24 adet (% 58.53) su örne?inden (Tablo 6) ve 67’si (% 69.79) 57 adet (% 39.04) bal?k örne?inden (Tablo 7) elde edilmi?tir.

Flavobacterium spp. izolatlar?n?n antibakteriyel duyarl?l?klar?

I. i?letmede saptanan Flavobacterium spp. izolatlar?ndan 20’si, II. i?letmedeki izolatlardan da 37’sinin antibakteriyel duyarl?l???na bak?lm??t?r. I. i?letmede incelenen izolatlar?n tamam?n?n eritromisin, neomisin, penisilin ve vankomisin’e dirençli oldu?u görülmü?tür. Bu izolatlardan 7’sinin (% 35) oksitetrasiklin’e, 6’s?n?n (% 30) gentamisin ve streptomisin’e, 5’inin (% 25) klindamisin’e, 3’ünün (% 15) sulfametoksazoltrimetoprim’e ve 2’sinin (% 10) amoksisilin/ klavulinik asit ve ofloksasin’e duyarl? olduklar? saptanm??t?r (Tablo 8).

II. i?letmede izole edilen 37 adet Flavobacterium spp.’nin antibakteriyel duyarl?l?klar?, s?ras?yla ofloksasin (% 48.6), klindamisin (% 37.8), gentamisin (% 35.1), oksitetrasiklin (% 29.7), neomisin (% 24,3), streptomisin (% 16.2), sulfametoksazol-trimetoprim (% 16.2), amoksisilin/ klavulinik asit (% 13.5), vankomisin (% 10.8), eritromisin (% 10.8) ve penisilin (% 8.1) olarak belirlenmi?tir (Tablo 9).

Gökku?a?? alabal??? yavrular?nda renkte kararma, gözlerde eksoftalmus, solungaçta ve karaci?erde solgunluk, karaci?erde kanamalar, dalakta büyüme ve % 70’lere varan ölümler öncelikle Flavobacterium psychrophilum’u akla getirmektedir (Austin, 1992, Bustos ve ark., 1995, Lorenzen ve ark., 1991, Toranzo ve Barja, 1993, Wiklund ve ark., 1994). Ülkemizde yap?lm?? olan ara?t?rmalar da benzer bulgular? göstermektedir (Balta, 1997, Diler ve Altun, 2003, ?spir ve ark., 2004, Timur ve ark., 2004). Ancak bu ara?t?rma kapsam?nda ne su ne de bal?k örneklerinde F. psychrophilum saptanamam??t?r. II. i?letmede, yem almaya ba?lad?ktan 30–40 gün sonra belirtilen hastal?k bulgular? yan?s?ra yavru bal?klar?n s?rt yüzgeçlerinin a??narak “eyer” ?eklini ald??? da görülmü?tür (?ekil 1 ve 2). Bu semptomlarla seyreden hastal???n etkeninin Flavobacterium columnare oldu?u birçok kaynakta yer almaktad?r (Austin ve Austin, 1993, Bernardet, 1989, Farmer, 2004, Figueiredo ve ark., 2005, Wakabayashi, 1993). Kolumnaris hastal??? %100’lere varan ölümlerle seyredebilmektedir (Austin ve Austin, 1993, Bernardet, 1989, Suomalainen ve ark., 2005, Wakabayashi, 1993). Birbirine yak?n iki i?letmede yürütülen bu ara?t?rmada F. columnare sadece II. i?letmenin su ve bal?k örneklerinde izole edilmi?tir. Saptanm?? olan bulgular?n deste?i ile II. i?letmedeki yavru bal?klarda meydana gelen % 50 oran?ndaki kay?plar?n kolumnaris hastal??? nedeniyle olu?tu?u anla??lmaktad?r. Ancak, kolumnaris hastal???n?n daha çok d?? belirtilerle seyretmesi, di?er klinik ve otopsi bulgular?n?n varl???, su s?cakl???n?n dü?üklü?ü ve di?er baz? bal?k patojenlerinin de saptanm?? olmas? miks bir infeksiyon olas?l???n? da akla getirmektedir. Nitekim, bu ara?t?rmaya paralel yürütülen di?er bir çal??mada ayn? bal?k ve su örneklerinden birçok Gram negatif basilin de saptand??? bildirilmi?tir (Özer ve ark., 2008).

Flavobacterium columnare’nin 13ºC’nin alt?nda nadiren hastal??a neden oldu?u, 18- 22ºC’lerde salg?nlara yol açt??? bildirilmi?tir (Austin ve Austin, 1993, Baur ve Rapp, 2003, Suomalainen ve ark., 2005, Wakabayashi, 1993). Bu çal??maya paralel yürütülen di?er ara?t?rmada salg?n?n görüldü?ü süreçte su s?cakl??? 11ºC civar?nda ölçülmü?tür (Özer ve ark., 2008). Salg?n?n meydana geldi?i i?letmede yavru havuzlar?n?n üstünün aç?k olmas? nedeniyle yavrular?n güne? ???nlar?yla direkt temasta olduklar? saptanm??t?r. Baur ve Rapp (2003) kuluçkahaneden havuzlara ya da göllere al?nan yavrularda güçlü güne? ???nlar? sebebiyle bal?klar?n gölge bulmaya çal??malar?n?n stres yaratarak hastal???n ortaya ç?kmas?na neden oldu?unu bildirmi?lerdir. Su s?cakl??? her ne kadar dü?ük olsa da, Mersin’in Nisan ay?ndaki yo?un güne?i alt?nda yavrular?n strese maruz kald?klar? dü?ünülmektedir.

Bu çal??mada su (Tablo 4 ve 6) ve bal?k örneklerinden (Tablo 5 ve 7) izole edilmi? olan Flavobacterium türleri bugüne kadar çe?itli bal?k türlerinde saptand??? bildirilen Flavobacterium türleri içinde yer almaktad?r (Austin ve Austin, 1993, Bernardet ve ark., 1996, Holt ve ark., 1993). Flavobacterium spp. izolatlar?n?n yumurta örnekleri hariç, tüm örneklerde, tüm geli?im basamaklar?nda var olduklar? görülmektedir (Tablo 5 ve 7). Baz? izolatlar ovaryum s?v?s?nda ve/veya spermada bulunmu?tur, ancak yumurtada saptanamam?? olmalar? anaçlardan yumurtaya bula?man?n olmad???n?, bula?man?n d??ar?dan su arac?l??? ile gerçekle?ti?ini dü?ündürtmektedir. Geli?im basamaklar?na göre bal?k örnekleri Flavobacterium spp. varl??? yönünden incelendi?inde (Tablo 5 ve 7) yem alan yavrulardaki say?sal art?? belirgin olarak dikkati çekmektedir. Flavobacterium spp.’nin bal?klar?n normal ba??rsak mikrofloras? içinde yer almas?, sindirimin ba?lamas? ile birlikte etkenlerin say?ca ço?almas? bu art???n nedenini aç?klamaktad?r. Ayr?ca çal??man?n tablolar? incelendi?inde en cok F. aquatile’ye rastlan?ld??? görülmektedir.

Yumurta, gözlenmi? yumurta ve keseli yavrulara povidin/iodin solüsyonu ile uygulanm?? olan dezenfeksiyonun Flavobacterium türlerini öldürmede etkisiz kald??? görülmektedir (Tablo 5 ve 7).

Bernardet (1989), F. columnare izolatlar?n?n streptomisin, tetrasiklin, eritromisin ve novobiosine duyarl?, gentamisin, neomisin, trimetoprime dirençli olduklar? bildirilmi?tir. Decostere ve ark. (1998) da bu etkenin eritromisin, oksitetrasiklin ve streptomisine duyarl?, sulfametoksazol ve neomisine dirençli olduklar?n? belirtmi?lerdir. Ara?t?rma bulgular?m?za göre en duyarl? antibakteriyel ilaçlar?n klindamisin, gentamisin, ofloksasin, oksitetrasiklin oldu?u, eritromisin, penisilin, vankomisin ve amoksisiline direncin ise çok yüksek oldu?u görülmektedir (Tablo 8 ve 9). Bu ara?t?rman?n antimikrobiyel duyarl?l?k test sonuçlar? (Tablo 8 ve 9) Flavobacterium spp.’nin genel olarak tüm antibakteriyel ilaçlara kar?? yüksek bir dirençlilik geli?tirdiklerini ortaya koymu?tur. Antibakteriyel direncin en duyarl? antibakteriyel ilaçta bile % 50’nin üzerinde olmas?, yanl?? ve gereksiz antibakteriyel ilaç kullan?mlar? neticesinde dirençli bakteri su?lar?n?n geli?ti?ini, hastal?k ç?kmas? durumunda sa?alt?mda zorluklar ya?anabilece?ini göstermektedir. Antibakteriyel direncin çok yüksek olmas? nedeniyle epizooti?in görüldü?ü i?letmeye herhangi bir ilaç önerilememi?tir.

Sonuç

Yap?lm?? olan bu proje sonuçlar? de?erlendirildi?inde, anaçlar?n sa??mlar? esnas?nda yumurta ve spermaya gaita bula?mas?n?n önüne geçilmesi, ölü yumurtalar?n sa?lamlardan ayr?lmas?, uygun bak?m ve besleme ko?ullar?n?n sa?lanmas?, yavru havuzlar?n?n gölgeliklerle güne?ten korunmas?, yeterli ve temiz suyun sa?lanmas?, gereksiz, uygun olmayan ve yanl?? ilaç kullan?mlar?n?n önüne geçilmesi için sa?alt?ma geçmeden önce antibakteriyel duyarl?l?k testinin yap?lmas? hastal?k ve ölümden meydana gelen kay?plar?n önüne geçilmesi için önemli oldu?u anla??lmaktad?r. Proje kapsam?nda elde edilmi? olan bu izolatlar?n patojenite ve virulans denemelerinin yap?lmas?, klasik yöntemlerle identifikasyonlar?n uzun zaman almas? nedeniyle polimeraz zincir reaksiyonu gibi moleküler tekniklerin bu projenin devam?nda uygulanmas? yararl? olacakt?r.

Te?ekkür

Friedrich-Loeffler Enstitüsü, Almanya’dan Dr. Günter Kotterba’ya Flavobacterium columnare referans su?u ve Åbo Akademi Universitesi, Finlandiya’dan Assoc. Prof. Dr. Tom Wiklund’a bilimsel deste?i için te?ekkürü bir borç bilirim.

1077

References

  1. Alvarado, V., Stanislavski, D., Boehm, K. H., Schlotfeldt, H. J., (1989). First isolation of Flexibactercolumnaris in eel (Anguilla anguilla) in Northwest Germany (Lower Saxony), Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 9(4): 96-97
  2. nAustin, B., (1992). The recovery of Cytophagapychrophila from two cases of rainbow trout (Oncorhynchusmykiss, Walbaum) fry Journal of FisheriesSciences.com YıldırımveÖzer, 4(1): 112-122 (2010) Journal abbreviation: J FisheriesSciences.com 121 sendrome in the U. K., Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 12(6): 207-208
  3. nAustin, B., Austin, D. A., (1993). Bacterial Fish Pathogens, Ellis, Horwood Limited, London. ISBN 971-8709-05-3
  4. nBader, J. A., Shoemaker, C. A., Klesius, P. H., (2003). Rapid detection of columnaris disease in channel catfish (Ictaluruspunctatus) with a new species-specific 16-S rRNA gene-based PCR primer for Flavobacteriumcolumnare, Journal of Microbiological Methods, 52(2): 209-220. doi:10.1016/S0167-7012(02)00208-7
  5. nBalta, F., (1997). Kültürüyapılanalabalıklarda (Oncorhynchusmykiss) görülenFlexibacterpsychrophilaenfeksiyonu, IX. Ulusal Su ÜrünleriSempozyumu, 17-19 Eylül 1997, Eğirdir/Isparta, 641-648
  6. nBasson, A., Flemming, L. A., Chenia, H. Y., (2007). Evaluation of adherence, hydrophobicity, aggregation and biofilm development of Flavobacteriumjohnsoniaelike isolates, Microbial Ecology, Springer Science&Business Media, LLC. doi:10.1007/s00248-007-9245-y
  7. nBaur, W. H., Rapp, J., (2003). GesundeFische, Blackwell Verlag GmbH, Berlin. ISBN 3- 8263-3402-7
  8. nBernardet, J. F., Baudin-Laurencin, F., Tixerany, G., (1988). First identification of Cytophagapsychrophila in France, Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 8(5): 104-105
  9. nBernardet, J. F., (1989). Flexibactercolumnaris: first description in France and comparison with bacterial strains from other origins, Diseases of Aquatic Organisms, 6: 37-44. doi:10.3354/dao006037
  10. nBernardet, J. F., Segers, P., Vancanneyt, M., Berthe, F., Kersters, K., Vandamme, P., (1996). Cutting a gordian knot: emended classification and description of the genus Flavobacterium, emended description of the family Flavobacteriaceae, and proposal of Flavobacteriumhydatis nom. nov. (Basonym, CytophagaaquatilisStrohl and Tait 1978), International Journal of Systematic Bacteriology, 46(1): 128–148. doi:10.1099/00207713-46-1-128
  11. nBrown, L. L., Cox, W. T., Levine, R. P., (1997). Evidence that the causal agent of bacterial cold-water disease Flavobacteriumpsychrophilum is transmitted with in salmonid eggs, Diseases of Aquatic Organisms, 29: 213-218. doi:10.3354/dao029213
  12. nBustos, P. A., Calbuyahue, J., Montana, J., Opazo, B., Entrala, P., Solervicens, R., (1995). First isolation of Flexibacterpsychrophilus, as causative agent of rainbow trout fry sendrome (RTFS), producing rainbow trout mortality in Chile, Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 15(5): 162-164
  13. nDecostere, A., Haesebrouck, F., Devriese, L. A., (1998). Characterization of four Flavobacteriumcolumnare (Flexibactercolumnaris) strains isolated from tropical fish, Veterinary Microbiology, 62: 35-45. doi:10.1016/S0378-1135(98)00196-5
  14. nDiler, Ö., Altun, S., (2003). KültürüyapılangökkuşağıalabalığındanizoleedilenFlavobacteriumpsychrophilum’unfenotipikkarakterleri, SüleymanDemirelÜniversitesi Fen BilimleriEnstitüsüDergisi, 7: 1-8
  15. nFarmer, B. D. (2004). Improved methods for the isolation and characterizatıon of Flavobacteriumcolumnare, Master Thesis, Northwestern State University, Louisiana, USA
  16. nFigueiredo, H. C. P., Klesius, P. H., Arias, C. R., Evans, J., Shoemaker, C. A., Pereira J., D. J. and Peixoto, M. T. D. 2005. Isolation and characterization of strains of Flavobacteriumcolumnare from Brazil, Journal of Fish Diseases, 28: 199-204. doi: 10.1111/j.1365-2761.2005.00616
  17. nFlemming, L., Rawlings, D. Chenia, H., (2007). Phenotypic and molecular characterisation of fish-borne Flavobacteriumjohnsoniae-like isolates from aquaculture systems in South Africa, Research in Microbiology, 158: 18-30. doi: 10.1016/j.resmic.2006.09.001
  18. nHolt, R. A., Rohovec, J. S., Fryer, J. L., (1993). Bacterial cold-water disease, in Inglis et al., Eds, Bacterial Diseases of Fish, Blackwell Scientific Publications 3-22, Oxford, UK. ISBN: 978-0-632-03497-0
  19. nHolt, J. G., Krieg, N. R., Sneath, P. H. A., Staley, J. T., William, S. T., (2000). Bergey’s Manual Journal of FisheriesSciences.com YıldırımveÖzer, 4(1): 112-122 (2010) Journal abbreviation: J FisheriesSciences.com 122 of Determinative Bacteriology, 9th Ed., Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia. ISBN 0-683-00603-7
  20. nİspir, Ü., Şeker, E., Sağlam, N., Dörücü, M., (2004). DoğuAnadoluBölgesi’ndebazıGökkuşağıalabalığı (Oncorhynchusmykiss) işletmelerindegörülenFlavobacteriumpsychrophilumenfeksiyonununaraştırılması, FıratÜniversitesi Fen veMühendislikBilimleriDergisi, 16(4): 718-724
  21. nKorun, J., Timur, G., (2001). Gökkuşağıalabalığında FMS üzerinebirçalışma, İstanbul Üniversitesi Su ÜrünleriDergisi, 12: 15-30
  22. nLehmann, J., Mock, D., Stürenbreg, F.-J., Bernardet, J. F., (1991). First isolation of Cytophagapsychrophila from a systemic disease in eel and cyprinids, Diseases of Aquatic Organisms, 10: 217-220. doi:10.3354/dao010217
  23. nLorenzen, E., Dalsgaard, L., From, J., Hansen, E. M., I,HФrlyck, V., Korsholm,H., Mellergaard, S., Olesen, N.J., (1991). Preliminary investigastions of fry mortality syndrome in rainbow trout, Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 11(2): 77- 79
  24. nMadsen, L., Møller, J. D., Dalsgaard, I., (2005). Flavobacteriumpsychrophilum in rainbow trout, Oncorhynchusmykiss (Walbaum), hatcheries: studies on broodstock, eggs, fry and environment, Journal of Fish Diseases, 28(1): 39-47. doi:10.1111/j.1365-2761.2004.00598
  25. nÖzer, S., Demirel, M., Us, M., Yıldırım, S. (2008). Mersin iliÇağlarcaköyü’ndekigökkuşağıalabalığı (Oncorhynchusmykiss, Walbaum) kuluçkahanelerininmikrobiyalflorası, Journal of Fisheries Sciences.com, 2(3): 261-271. doi:10.3153/jfscom.mug.200713
  26. nRogers, R., Chapman, P. F., (1990). Variation in iodine concentration during water hardening of salmonid eggs, Proceedings of the 41st Annual Northwest Fish Culture Conference, Fish Culture, Department of Fish and Game Boise, Idaho, 120-129
  27. nSuomalainen, L. R., Tiirola, M. A., Valtonen, E. T., (2005). Influence of rearing conditions on Flavobacteriumcolumnare infection of rainbow trout, Oncorhynchusmykiss (Walbaum), Journal of Fish Diseases, 28: 271-277. doi:10.1111/j.1365-2761.2005.00631
  28. nThomas-Jinu, S., Goodwin, A. E., (2004). Acute columnaris infection in channel catfish, Ictaluruspunctatus (Rafinesque): Efficacy of practical treatments for warmwater aquaculture ponds, Journal of Fish Diseases, 27: 23-28. doi:10.1046/j.1365-2761.2003.00504
  29. nTimur, G., Timur, M., Korun, J., (2004). Türkiye’debiralabalık (Oncorhynchusmykiss) kuluçkahanesindeFlavobacteriumpsychrophilumenfeksiyonunçıkışıüzerinebirçalışma, İstanbul Üniversitesi Su ÜrünleriFakültesiDergisi, 17: 21-27
  30. nToranzo, A. E., Barja, L. J., (1993). Fry Mortality Syndrome (FMS) in Spain. Isolation of the causative bacterium Flexibacterpsychrophilus, Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 13(1): 30- 32
  31. nWakabayashi, H., (1993). Columnaris disease, in Inglis et al., Eds, Bacterial Diseases of Fish, Blackwell Scientific Publications 23-39, Oxford, UK. ISBN: 978-0-632-03497-0
  32. nWiklund, T., Kaas, K., Lönström, L., Dalsgaard, I., (1994). Isolation of Cytophagapsychrophila (Flexibacterpsychrophilus) from wild and farmed rainbow trout (Oncorhynchusmykiss) in Finland, Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 14(2): 44-46
  33. nWoodland, J., (2004). Bacteriology. NWFHS laboratory procedures manual, 2nd edn. Chapter 5, pp. 44. Pinetop Fish Health Center, Arizona, available at: https://www.fws.gov/wildfishsurvey/manual/N